Фриденштейн был доктором наук, профессором и членом-корреспондентом РАМН.

В 1946 году Фриденштейн окончил обучение в первом Медицинском Московском Институте. В 1950-1958 году он был младшим научным сотрудником, с 1958 года его назначали старшим научным сотрудником, а в 1961 году он работал заведующим в лаборатории. С 1990 года Фриденштейн стал руководителем группы в НИИ микробиологии и эпидемиологии им. Н.Ф.Гамалеи.

С 1960 года он начал руководить курсом биологии иммуноморфологии и клетки на кафедре гистологии МГУ.

Все го основные научные труды были посвящены вопросам относительно кроветворения и остеогенеза.

Когда Фриденштейн Александр Яковлевич осуществлял эксперименты по гетеротопной пересадке костного мозга, ему удалось установить, что происхождение мозговых стромальных клеток никак не зависят от кроветворных клеток, таким образом, во взрослом организме у этих двух клеток нет общего ствольного предшественника. В общем как сказал сам Александр Яковлевич “гетеротопная пересадка мозга это вам не тиражирование cd”.